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      单细胞测序
          发布时间: 2018-04-16 17:51    

      一、服务介绍 

      随(sui)着现代(dai)生(sheng)物学(xue)的(de)发展,基(ji)于细(xi)胞(bao)群体(ti)的研究已无(wu)法(fa)解决细(xi)胞(bao)异质(zhi)性的难题。单细胞(bao)测序(xu)通过(guo)对(dui)单(dan)个细(xi)胞(bao)进行基因组(zu)或(huo)转(zhuan)录组测序(xu),解决了1)用组(zu)织样本无法获得不同(tong)单个(ge)细胞的异质(zhi)性信息(xi)、2)样本(ben)量太(tai)少无法进(jin)行常(chang)规(gui)测序(xu)的(de)难题(ti),为(wei)科学家研究(jiu)解(jie)析(xi)单个细胞(bao)的(de)行为(wei)、机制、与(yu)机(ji)体(ti)的(de)关系等(deng)提(ti)供了(liao)新(xin)方向。

      2011 年,《Nature Methods》杂志将单细(xi)胞测(ce)序列为(wei)年(nian)度值(zhi)得期(qi)待的技术之一[1];2013 年,《Science》杂(za)志将(jiang)单(dan)细胞(bao)测序(xu)列为(wei)年度(du)最(zui)值(zhi)得关注的六大(da)领域榜(bang)首[2], 单细(xi)胞(bao)测(ce)序已成为科(ke)研(yan)热点(dian)。目前,单(dan)细胞(bao)测(ce)序(xu)主(zhu)要涉(she)及全(quan)基因组DNA、外显子、mRNA 以及lincRNA(同时获得lincRNA 和mRNA 的序列和

      表达信息)四个方面。

       

      二、服务流程

       

      二、技术参数

      细胞分离:由合作方(fang)完(wan)成(cheng)单细(xi)胞(bao)分离(li)工作

      样本要求

      (1)DNA 水平:单个细胞,单染色体少量(liang)细胞等(deng)稀(xi)有样本(ben)或 0.5 pg 的基因组 DNA

      (2)RNA 水平:单个细胞、微量细胞(几个到几千个)和微量Total RNA(10 pg–10 ng)中含PolyA 尾的RNA

      扩增技术:MALBAC/SMART 扩增技术

      测序策略:Illumina HiSeq 平台;PE150

      测序深度:可根据老(lao)师(shi)研究目(mu)的(de)选择合适(shi)测序(xu)深度(du)

      项目周期:46 天(单细胞基因组/ 外显子:扩增10 天,建库测序分析36 天)

      50 天(单细胞转录组:扩增10 天,建库测序分析40 天)

      70 天(单细胞lincRNA:扩增10 天,建库测序分析60 天)

       

      、分析项目

      定(ding)制化(hua)信(xin)息分(fen)析,可结(jie)合客(ke)户(hu)的(de)需求,协(xie)商确(que)定(ding)定制(zhi)化信(xin)息(xi)分析内(nei)容

       

      四、结果案例

      单(dan)精(jing)子全基因组测序探(tan)索(suo)染(ran)色(se)体重(zhong)组本研(yan)究采(cai)用(yong)最(zui)新发明(ming)的多次退火循(xun)环扩增技(ji)(MALBAC),对一(yi)名亚洲(zhou)男(nan)性(xing)及(ji)其99 个精子(zi)进(jin)行(xing)了(liao)单细胞全(quan)基(ji)因组(zu)测序(xu),测序深度分别

      70X 和1X,构建了个人遗(yi)传图谱,并分(fen)析减数(shu)分(fen)裂期(qi)间(jian)同(tong)源(yuan)染(ran)色体之间(jian)的(de)片段(duan)交(jiao)叉重组(zu)(crossover)事件。研(yan)究(jiu)表明(ming)个体水平(ping)上(shang)基(ji)因(yin)区(qu)附(fu)近(jin)的(de)重(zhong)组率(lv)降低现象是由(you)分(fen)子(zi)机(ji)制(zhi)决(jue)定,而非自(zi)然选择的(de)结(jie)果。染色(se)体数(shu)目异(yi)常(chang)是(shi)造成某(mou)些先天性(xing)出生缺(que)陷(xian)的(de)重要(yao)原(yuan)因(yin)。这(zhe)一研究(jiu)结(jie)果(guo)将有(you)助于研(yan)究(jiu)人(ren)类染色体(ti)重组(zu)规律,探(tan)索先天性出生(sheng)缺(que)陷(xian)的遗传(chuan)机(ji)理。

       

      crossover 分布图

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