永利网站游戏_厦门基科生物科技有限公司

     
    181-5037-7590


    customer_service@rifkadejavu.com
    您好,欢迎到永利网站游戏-分子生物(wu)学服务中心(xin)

    宏转录组测序
        发布时间: 2018-04-16 17:51    

    一、服务介绍 

    宏转录组(Metatranscriptomics)是指从整体水平(ping)上研(yan)究(jiu)某(mou)一(yi)特定环(huan)境(jing),特(te)定时(shi)期群体生(sheng)命全(quan)部基因(yin)组转录情况以(yi)及(ji)转录调(diao)控(kong)规(gui)律(lv),它以生(sheng)态(tai)环境中的全(quan)部(bu)RNA为研究对象,避(bi)开(kai)了(liao)微生(sheng)物(wu)分(fen)离(li)培(pei)养(yang)困难的问题,能(neng)有效(xiao)的扩(kuo)展(zhan)微生物资源(yuan)的利用空间。相(xiang)较于(yu)宏基因组(zu),宏转录(lu)组(zu)能(neng)从(cong)转(zhuan)录(lu)水平(ping)研(yan)究(jiu)复(fu)杂微(wei)生(sheng)物群落(luo)变(bian)化,能(neng)更好(hao)的(de)挖(wa)掘潜(qian)在的新(xin)基因(yin)。

    二、服务流程

    1、Total RNA样品检测

    2、rRNA去除

    3、双链cDNA合成

    4、末端修复,加A和接头

    5、片段选择,PCR富集

    6、文库质量检测

    7、上机测序

    三、技术参数

    RNA样本(不(bu)提(ti)供提(ti)取(qu)服(fu)务(wu)):

    RNA:总量≧2.5μg(单次建库),浓度≧65ng/μl;OD260/280≧1.8,23S/16S≧1,

    RIN≧6.0;无基因组污染,无蛋(dan)白(bai)和(he)杂(za)质(zhi)污(wu)染,无颜色异常。

    周期:60个自然日

    案例:

    本(ben)研(yan)究(jiu)发现了遍(bian)布(bu)世(shi)界(jie)海(hai)洋(yang)、结构(gou)复杂(za)的单(dan)细(xi)胞(bao)藻类(lei)——硅(gui)藻(zao)会在一(yi)种细(xi)菌(jun)存在时以更快的速(su)度生长(chang),这一细(xi)菌(jun)能够(gou)释放一(yi)种(zhong)已(yi)知的(de)可以(yi)加速陆地(di)植(zhi)物生长(chang)的(de)激(ji)素。实验(yan)人(ren)员在项(xiang)目(mu)的起(qi)始(shi)期(qi)对(dui)收(shou)集自(zi)北太(tai)平(ping)洋(yang)和(he)大(da)西(xi)洋(yang)5个地方的(de)一种(zhong)常见海岸硅(gui)藻(zao)——多列拟菱形藻(Pseudo-Nitzschia multiseries) 进行了检测,发现(xian)其中(zhong)有细(xi)菌存在。接下来,他(ta)们处(chu)理了(liao)水(shui)样本中所(suo)有细(xi)菌(jun),发现(xian)硅(gui)藻无(wu)法(fa)繁(fan)殖(zhi)。之后,实验人员将5个样(yang)本共有的(de)细(xi)菌(jun)一(yi)次一个(ge)添加(jia)回(hui)去(qu),发(fa)现(xian)当以(yi)足够(gou)高的浓度(du)添(tian)加(jia)一(yi)种叫(jiao)做(zuo)Sulfitobacter的细(xi)菌时(shi)会(hui)显著加(jia)速(su)硅(gui)藻生(sheng)长(chang)。因此(ci)证实(shi)这(zhe)些(xie)细(xi)菌与硅(gui)藻交换(huan)物质(zhi),转(zhuan)而(er)生(sheng)成(cheng)了(liao)生(sheng)长(chang)素(su)——一种(zhong)由生(sheng)活(huo)在(zai)陆地植(zhi)物根部周(zhou)围的(de)微(wei)生(sheng)物(wu)生成(cheng)的激(ji)素(su)。实验(yan)人(ren)员还通(tong)过(guo)代(dai)谢(xie)组学(xue)和宏转(zhuan)录(lu)组学方(fang)法(fa)识别(bie)出了IAA和与海洋中IAA的生

    成相(xiang)关(guan)的(de)一(yi)些基因,但还(huan)需(xu)要进一(yi)步的工作(zuo)来充(chong)分(fen)研(yan)究该(gai)通(tong)道的生(sheng)态(tai)学意义。


    181-5037-7590
    联系电话

    公司邮箱:customer_service

    @rifkadejavu.com?

    Service center
    技术服务中心